来源:University of California San Diego
作者:Ben Coxworth
文章由机器翻译
一种新技术涉及熔化血液样本中发现的细菌DNA,可以比以往任何时候都更快地诊断出潜在的致命感染。结果可以在几个小时内获得,而不是几天。
通常,为了查看某人的血液中是否存在有害细菌,将他们的血液样本放入培养皿的生长培养基中。如果细菌确实在血液中,它们就会继续生长。然而,在它们增长到可检测的水平之前,可能需要 15 小时到几天的时间。
在Stephanie Fraley教授的带领下,加州大学圣地亚哥分校的科学家们一直在探索一种更快、更准确的替代方案。
他们开发了一种微流控芯片,将少量血液样本沉积在上面,然后加热到50至90ºC(122至194ºF)的温度。如果液体中存在任何细菌,热量会导致它们的 DNA 分子熔化。当这些分子分解时,它们的双螺旋链以一种明显的模式展开,这是它们的核苷酸序列所独有的。
为了确定这种模式,在样品中加入一种特殊的染料。它使放卷过程产生荧光。通过分析该光的特性,可以获得称为熔化曲线的特征。然后将该熔解曲线与已知是特定细菌的其他熔解曲线进行比较。
一旦找到匹配项,就会识别血液样本中的细菌。整个过程不超过六个小时。如果不是使用自定义的机器学习算法来识别和丢弃患者自身DNA的熔解曲线以及其他“背景噪音”,这种速度是不可能的。
在对该技术的测试中,分析了从17名疑似患有潜在致命败血症感染的儿童身上提取的血液样本。这项新技术不仅与传统方法获得的结果完全匹配,而且没有产生任何误报。其他方法(如核酸扩增)并非总是如此,它们只是增强了所有存在的DNA的特征。
“这是这种方法首次在疑似败血症患者的全血上进行测试,”Fraley说。“因此,这项研究是对该技术在实际临床场景中的表现的更现实的预览。