大家好,今天和大家分享一下TCGA从2017年到现在发表文章的情况;做这个整理的目的呢?是因为很多小伙伴都在群里或者是后台问我们,TCGA的生信分析往哪里投?
我们在PubMed中进行检索TCGA的关键词,检索得到9334个结果;并且相关的发文量一直呈现出逐年递增的趋势,2019年就有2702篇文章。
因为关注我们公众号的小伙伴,对发表在SCI上的情况更为关心,所以我们在GeenMedical检索中限定了IF大于0的文章,然后进行了统计。
在2019年有2400多篇是SCI文章,并且到了2020年更是预计有3300多篇。(截止2020年6月21日有1659篇文章发表,所以我们估算2020年大致为3320篇)
那在这几年里面利用TCGA数据库发表文章前20的杂志有哪些呢?
其中发表文章最多的杂志分别为Sci Rep、Front Oncol和Cancers (Basel);此外我们还发现,有9本杂志发表了100+篇TCGA相关的文章,值得注意的是,仅仅这20本杂志的发文量已经占到了超过所有TCGA数据挖掘SCI发文量的五分之一。
我们把发表的文章分成了4档,0-3分、3-5分、5-10分和10+分。我们再来看看不同分段的文章发表是怎样的情况。
分段1:0-3分
在这个分段有超过39个杂志在2017年到现在发表文章超过10篇,对于分析比较简单的小伙伴,可以考虑这些杂志,这里面大部分的杂志对国人都还是比较友好的。
分段2:3-5分
我们可以发现,这部分的有49个杂志发表TCGA数据库文章超过10篇。并且我们对比可以发现,这部分杂志才是发文量的“中坚力量”,特别是在Sci Rep、Front Oncol、J Cancer、Onco Targets Ther、Cancer Cell Int和Front Genet这6本杂志,都是超过了100的TCGA文章发表量!Oncol Rep也有99篇紧随其后。
分段3:5-10分
在5-10分的这个分段,其实已经不是很多人能够灌水的了,当然Cancers和Aging可能是这里面相对而言会容易发表一些;但是因为MDPI杂志集团对国内医院的稿件并不友好,所以可能稍微难一些。一些非医院的高校或合适机构还是可以试一试的;此外Cancers的特刊,各位也是可以考虑一下的。
CCR、JECCR和Oncogene这样的杂志,大部分是通过TCGA数据对湿实验进行验证性质的使用TCGA数据库的。
分段4:10+分
最后的话,就是10+分这样的顶刊了。这一部分的,是小编这样的科研民工很难接触到的,但是根据以往发表的文献看来的话,NAR对算法,数据库和实验比较看重,套路基本上是不太可能的。Nat Commun和后面的杂志等对新颖性的要求都很高。
这次和大家的分享就到这里啦,如果想要下图的完整文章列表,请后台回复:TCGA 进行获取。
