肠道菌群失调的诊断
肠道菌群失调症的诊断依据有:1有引起肠道菌群失调的原因;2肠道菌群失调症的临床表现如腹泻、腹胀、腹痛、腹部不适等;3肠道菌群失调实验室检查异常。上述2和2为临床诊断依据，也是诊断肠道菌群失调症的必需条件，如果在实验室检查中出现任何项异常即可诊断。
肠道菌群失调的治疗
(一)积极治疗原发疾病，纠正诱发因素
积极治疗各种原发疾病，如各种腹泻病、炎症性肠病、肠易激综合征、肝硬化、胆汁能积等，在这些疾病中，大部分情况下，无须使用抗菌药物治疗，如果需要，尽量用窄谱抗菌药物短期应用。在腹部围手术期的处理中，避免滥用抗菌药物预防感染。在使用制酸剂、抗肿瘤化疗药物时，可以补充益生菌药物，以减少这些药物对肠道菌群的影响。
(二)改善机体免疫功能，纠正营养不良
全身状况如机体免疫功能和营养状态也是影响肠道菌群的重要因素之一，对有免疫功能低下和营养不良的患者，应该及时纠正。另外，避免长期禁食对肠道菌群的影响。
(三)积极使用微生态制剂，纠正菌群失调
益生菌是目前临床使用最为广泛的微生态制剂，可以依据菌株的来源和作用机制，分为原籍菌制剂、共生菌制剂和真菌制剂。原籍菌制剂所使用的菌株来源于人体肠道原籍菌群，服用后可以直接补充原籍菌发挥作用，如双歧杆菌、乳杆菌、粪链球菌、酪酸梭菌等。共生菌制剂所使用的菌株来源于人体肠道以外，与人体原籍菌有共生作用，服用后能够促送原籍菌的生长与繁殖或直接发挥作用，如芽孢杆菌、枯草杆菌等。真菌制剂有布拉氏酵母菌益生菌为活的微生物，因此应避免与抗菌药物同时服用，以免影响疗效。若需同时用抗菌药物以控制严重感染，可错开服药时间，两者最好间隔 2~3h，胃肠道外使用抗物影响较小。含酪酸菌、芽孢菌和布拉氏酵母菌的制剂对抗菌药物不敏感，可以与抗物同时使用。
益生菌安全性良好，可以用于所有肠道菌群失调的预防和治疗。
(四)选择性使用针对特定致病菌的抗菌药物
如出现二重感染和全身感染，应该选择性使用抗菌药物，治疗特定致病菌的感染,如艰难梭菌、葡萄球菌、铜绿假单胞菌和念珠菌感染等。
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